GoGPT Best VPN GoSearch

Значок OnWorks

TransDecoder.Predict - онлайн у хмарі

Запустіть TransDecoder.Predict у постачальника безкоштовного хостингу OnWorks через Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS

Це команда TransDecoder.Predict, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн- емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS

ПРОГРАМА:

ІМ'Я


Трансдекодер – передбачення транскриптомного білка

ВИКОРИСТАННЯ


Вимагається:

-т стенограми.fasta

Поширені варіанти:

--retain_long_orfs зберігають усі знайдені ORF, які рівні або довші за ці багато нуклеотидів, навіть якщо немає інших доказів
позначає його як кодування (за замовчуванням: 900 bp => 300aa)

--retain_pfam_hits /path/to/pfam_db.hmm для пошуку
за допомогою hmmscan (до якого має бути доступ через налаштування PATH)

--retain_blastp_hits

Додаткові параметри

--поїзд Файл FASTA з ORF для навчання Markov Mod для ідентифікації білка; інакше
найдовші використані ненадлишкові ORF

-Т Якщо немає --train, найдовший ORF для навчання моделі Маркова (статистика гексамера) (за замовчуванням: 500)

2015-12-28 TRANSDECODER.PREDICT(1)

Використовуйте TransDecoder.Predict онлайн за допомогою служб onworks.net


Безкоштовні сервери та робочі станції

Завантажте програми для Windows і Linux

Команди Linux

Ad




×
реклама
❤️Робіть покупки, бронюйте або купуйте тут — безкоштовно, це допомагає зберегти послуги безкоштовними.