Це програма для Linux під назвою Athus, останню версію якої можна завантажити як Athus-1.8.9.2-sources.tar.gz. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та безкоштовно запустіть цю програму під назвою Athus із OnWorks онлайн.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
Атус
Ad
ОПИС
Цей проект допомагає вам виконувати популяційний генетичний аналіз, беручи на себе потворні, нудні та схильні до помилок кроки маніпулювання даними.
Починаючи з чітко визначених вхідних форматів VCF, BED і FASTA та унікального файлу конфігурації, що описує дані (наприклад, із масивів SNP або послідовності), а також фільтруючи, можна створити стандартні формати POPGEN, такі як Eigenstrat, PEDMAP (PLINK), Treemix ...
Крім того, є кілька утиліт для
* створення VCF з даних SNPArray (NCBI - GEO, файли викликів Illumina)
* робота з генетичними картами...
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Консоль/Термінал, командний рядок
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/bioathus/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.