Це програма для Linux під назвою BiomeNet для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як BiomeNet.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою BiomeNet для безкоштовного запуску в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
BiomeNet для роботи в Linux онлайн
Ad
ОПИС
Метагеноміка дає величезну кількість мікробних послідовностей, яким можна призначити метаболічну функцію. Використання таких даних для висновку про метаболічні розбіжності на рівні громад заважає відсутність відповідної статистичної бази. Тут ми описуємо нову ієрархічну байєсівську модель, яка називається BiomeNet (байєсівський висновок метаболічних мереж), для висновку про диференційну поширеність метаболічних мереж серед мікробних спільнот. Щоб зробити висновок про структуру метаболічних взаємодій на рівні спільноти, BiomeNet застосовує систему моделювання змішаних членів до інформації про кількість ферментів. Основна ідея полягає в тому, що компоненти суміші моделі (метаболічні реакції, підмережі та мережі) розподіляються між усіма групами (зразки мікробіомів), але пропорції суміші варіюються від групи до групи. За допомогою цієї структури модель може захоплювати вкладені структури в даних. BiomeNet унікальний у моделюванні кожного зразка метагенома як суміші складних метаболічних систем (метабосистем).Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
C++, S/R
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/biomenet/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.