Це програма для Linux під назвою CAMPARI для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як campari_v3_09052017.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою CAMPARI для безкоштовного запуску в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
CAMPARI для запуску в Linux онлайн
Ad
ОПИС
Ми з гордістю представляємо версію 3 CAMPARI. Це великий крок у порівнянні з версією 2, насамперед завдяки повній підтримці OpenMP (паралелізм потоків), а також завдяки значним покращенням як зручності використання, так і продуктивності. Ми також знову додали ряд нових алгоритмів з нещодавньої літератури, і CAMPARI, звичайно, продовжує підтримувати парадигму силового поля ABSINTH і модель неявної сольватації.CAMPARI — це спільний пакет для виконання та аналізу молекулярного моделювання, зокрема полімерів біологічного значення. Він зосереджений на широкому доступі алгоритмів для (розширеного) відбору проб і здатний безперешкодно поєднувати вибірку за методом Монте-Карло та молекулярно-динаміку. CAMPARI пропонує користувачеві дуже високий рівень контролю над усіма реалізованими функціями. Для отримання додаткової інформації та функцій перейдіть на домашню сторінку проекту за адресою http://campari.sourceforge.net. Версія 2 більше не підтримується, але остаточна версія залишається доступною.
Функції
- Комбінована вибірка MC і MD, MD в декартовому або торсіонному просторі/просторі твердого тіла
- Ефективне розпаралелювання OpenMP всіх основних процедур енергії/сил
- Аналіз "на льоту" або виконання як інструмент аналізу траєкторії (також паралельно)
- Багато вбудованих програм аналізу (DSSP, карти контактів, функції парної кореляції тощо)
- Підтримка кількох структурних кластеризацій та пов’язаних алгоритмів разом із аналізом моделі стану Маркова
- Повністю задокументовано (HTML) і на додаток додається 13 навчальних посібників
- Дуже високий рівень контролю (наприклад, спеціальні голономні обмеження в MD)
- Широка підтримка методів паралельного моделювання кількох реплік, таких як обмін репліками в гібридному паралельному виконанні MPI/OpenMP
- Автономний засіб аналізу для кластеризації/моделі стану Маркова
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Консоль/Термінал
Мова програмування
Фортран
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/campari/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
