Це програма для Linux під назвою CSBB-v3.0, останню версію якої можна завантажити як CSBB-v3.0.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть цю програму під назвою CSBB-v3.0 з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
CSBB-версія 3.0
Ad
ОПИС
CSBB — це набір біоінформатики на базі командного рядка для аналізу біологічних даних, отриманих за допомогою різноманітних шляхів біологічних експериментів. CSBB реалізовано в Perl, а також використовує R, java, python і ruby у фоновому режимі для певних модулів. Основна ціль CSBB полягає в тому, щоб дозволити користувачам з біології та біоінформатики отримувати переваги, виконуючи завдання аналізу нижнього потоку, усуваючи необхідність писати програмний код. CSBB наразі доступний на Linux, UNIX.Наразі CSBB надає 18 модулів, зосереджених на аналітичних завданнях, таких як виконання нормалізації верхнього квантиля, інтерактивна візуалізація та конвеєри послідовності наступного покоління. CSBB тепер також має можливість обробляти публічні дані. Надання користувачам досвіду роботи з конвеєром від кінця до кінця.
Функції
- РНК-Seq
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- Нормалізація
- Диференціальний вираз
- Обробка публічних даних
- Від кінця до кінця трубопроводів
- Open Source
- Візуалізація
- біоінформатика
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Perl
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
