Це програма для Linux під назвою FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як ffp-3.19.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny для роботи в Linux онлайн
Ad
ОПИС
FFP (Feature frequency profile) — це інструмент порівняння без вирівнювання для філогенетичного аналізу та порівняння тексту. Його можна застосувати до нуклеотидних послідовностей, повних геномів, протеомів і навіть використовувати для порівняння тексту.Функції
- Порівняння геномів, послідовностей білків і нуклеїнових кислот у форматі FASTA
- Вихід матриці відстані у стилі Філіпа
- Понад десяток вимірювань відстані
- Використовує метод порівняння без швидкого вирівнювання
- Реалізація швидкого хешування Рабіна-Карпа для підрахунку k-mer
- Хеш-функція розподіленого насіння/маскування дозволяє невідповідності ДНК/амінокислот
Аудиторія
Наука/Дослідження, Освіта
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Unix Shell, Perl, C
Середовище бази даних
Плоский файл
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/ffp-phylogeny/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
