Це програма для Linux під назвою Hamstr, останню версію якої можна завантажити як hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою Hamstr з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
Hamstr
Ad
ОПИС
HaMStR переїхав до https://github.com/bionf/hamstr де він зараз є частиною пакету HaMStR-OneSeq.
HaMStR — це інструмент на основі прихованої моделі Маркова для спрямованого пошуку ортологів у даних EST або послідовності білків. Програма бере на вхід попередньо визначену основну групу ортологічних послідовностей (основних ортологів) і набір послідовностей із таксону пошуку. Потім HaMStR поєднує у двоетапній стратегії пошук на основі pHMM та зворотний пошук через BLAST, щоб розширити основну ортологічну групу новими послідовностями пошукового таксону.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Perl
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/hamstr/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
