Це програма для Linux під назвою High-Throughput Tabular Data Processor, останню версію якої можна завантажити як htdpinstaller.exe. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою Високопродуктивний табличний процесор даних із OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
Високопродуктивний табличний процесор даних
ОПИС
ПРОЦЕСОР ТАБЛИЧНИХ ДАНИХ ВИСОКОЇ ПРОПУСКНОСТІ (HTDP) — це програма Java, яка призначена для полегшення завдань дослідження та скорочення даних у великих текстових файлах, що є результатом високопродуктивних технологій, наприклад, масивного паралельного секвенування або мікрочипів. Програмне забезпечення було оптимізоване для даних мікрочипів і глибокого паралельного секвенування, однак воно може приймати будь-які табличні набори даних із символьними роздільниками. HTDP також може імпортувати, обробляти та конвертувати файли Variant Call Format (VCF) вер. 4.0, 4.1 і 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP забезпечує функцію швидкої фільтрації та може обробляти дані, що складаються з одного або кількох вхідних файлів.
Цитування: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK та ін. (2018) Високопродуктивний табличний процесор даних – незалежний від платформи графічний інструмент для обробки великих наборів даних. PLOS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Функції
- працює з будь-якими даними стовпців із роздільниками символів (наприклад, BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- об'єднувати файли табличних даних по вертикалі та горизонталі
- об'єднати будь-які файли табличних даних, використовуючи розташування геному або загальні стовпці
- необмежені можливості фільтрації та скорочення даних
- різні файли щодо формату та вмісту можна аналізувати одночасно
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/htdp/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
