Це програма для Linux під назвою HMCan, останню версію якої можна завантажити як HMCan.tar.gz. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть цю програму під назвою HMCan with OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
HMCan
Ad
ОПИС
HMCan — це інструмент на основі прихованої моделі Маркова, який розроблено для виявлення модифікації гістонів у даних ChIP-seq раку. Він застосовує три кроки корекції до даних: виправлення числа копій, корекція зсуву ГХ і корекція рівня шуму.
Щоб запустити HMCan, потрібен цільовий файл вирівнювання ChIP-seq та файл вирівнювання контролю. Також потрібна деяка конфігурація, для отримання додаткової інформації перевірте файл README.
Автор: Haitham Ashoor
Контактна особа: Валентина Боєва Інститут Кюрі
Університет науки і техніки імені короля Абдалли Хайтам Ашор.
Мова програмування
C + +
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/hmcan/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.