Це програма для Linux під назвою MendelChecker, останню версію якої можна завантажити як MendelChecker_v2.tar.gz. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою MendelChecker з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
MendelChecker
Ad
ОПИС
MendelChecker — це заснований на імовірності міра менделівської сегрегації однонуклеотидних поліморфізмів (SNP) у ядерних родовідах. Ми розробили цей метод як захід контролю якості для виявлення нових варіантів на основі шумних даних секвенування наступного покоління в родовідах, таких як секвенування ДНК, пов’язане з сайтом рестрикції (RAD-seq) у немодельних організмів. Цей метод реалізує порівняння гетерогаметної та гомогаметичної передачі, тобто зчеплення зі статтю та аутосомної сегрегації.
риси
- Виміряти ймовірність менделівської передачі в родовідах
- Призначення аутосом і статевих хромосом
- Зчитує стандартний вихід GATK
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.