Це програма для Linux під назвою Natural product likeness calculator, останню версію якої можна завантажити як Natural_Product_Likeness_calculator_2.1.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою «Калькулятор подібності природних продуктів» з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
Калькулятор подібності натурального продукту
Ad
ОПИС
Обчислює подібність молекули до природного продукту (NP), тобто подібність молекули до структурного простору, охопленого відомими природними продуктами. Подібність NP є корисним критерієм для скринінгу бібліотек сполук і розробки нових сполук свинцю.
Залежність від Maven:
uk.ac.ebi.cheminformatics
NP-подібність
2.1
Необхідний репозиторій:
ebi-repo
Репозиторій EBI maven
http://www.ebi.ac.uk/~maven/m2repo
помилковий
Остання версія проекту доступна тут, у нашому репо GIT https://github.com/CS76/NP-Likeness
риси
- Перевірте наявність зайвих структур у наборі даних
- Стандартизація молекул (Видалення протиіонів і металів)
- Видаліть лінійний і кільцевий цукор
- Створення сигнатур атомів
- Розрахувати схожість натурального продукту даної молекули на основі доступних відкритих даних про натуральні продукти
- SDF і SMILES для вводу-виводу
- Використовуйте свій власний навчальний набір для обчислення балів
Мова програмування
Java
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/np-likeness/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.