Це програма для Linux під назвою ParDRe, останню версію якої можна завантажити як ParDRe-rel2.2.5.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою ParDRe з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ParDRe
Ad
ОПИС
ParDRe — паралельний інструмент для видалення повторюваних читань. Повторювані читання можна розглядати як ідентичні
або майже ідентичні послідовності з деякими невідповідностями. Цей інструмент дозволить користувачам уникнути аналізу непотрібних читань, скорочуючи час наступних процедур з набором даних (наприклад, збірки, відображення тощо).
Інструмент реалізовано за допомогою MPI для використання паралельних можливостей багатоядерних
кластери. Він швидший за багатопотокові аналоги (кінець 2015 року) для такої ж кількості ядер і завдяки технології передачі повідомлень може виконуватися на кластерах.
Існує також аналог ParDRe MapReduce, який називається MarDRe (див. посилання вище).
ОНОВЛЕННЯ: Починаючи з версії 2.0.5 ParDRe також підтримує видалення лише оптичних дублікатів (і залишаючи біологічно цікаві дублікати), а також роботу зі стиснутим введенням/виводом у форматі .gz.
Аудиторія
Інформаційні технології, промисловість охорони здоров’я, наука/дослідження
Користувацький інтерфейс
Консоль/Термінал, командний рядок
Мова програмування
C + +
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/pardre/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
