Це програма для Linux під назвою PPIXpress, останню версію якої можна завантажити як PPIXpress_1.23.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою PPIXpress з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
PPIXpress
ОПИС
Хоча мережі взаємодії білка і білка є повсюдним компонентом сучасної системної біології, було зроблено порівняно небагато зусиль, щоб пристосувати їх топологію до фактичного досліджуваного стану клітини. Оскільки просте зведення мереж до підмножини експресованих генів лише подряпає поверхню регуляторних можливостей вищих організмів, ми пропонуємо вдосконалений метод PPIXpress, який дозволяє використовувати дані експресії на рівні транскрипту і, таким чином, також може виявляти зміни в з'єднання білків, викликане альтернативним сплайсингом.
Оригінал публікації можна знайти на https://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/4/571 .
риси
- автоматична побудова мереж протеїнової взаємодії
Аудиторія
Промисловість охорони здоров'я, наука/дослідження
Користувацький інтерфейс
Java Swing, консоль/термінал, командний рядок
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/ppixpress/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.