Це програма для Linux під назвою Seal, останню версію якої можна завантажити як seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою Seal with OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
Друк
Ad
ОПИС
Seal — це розподілений набір інструментів для коротких читань і аналізу на основі Hadoop. На даний момент Seal включає інструменти для: демультиплексування зчитування, вирівнювання читання, видалення дублікатів читання, сортування зіставлення читання та обчислення статистики для емпіричного перекалібрування базової якості. Ущільнюють ваги, легко обробляють ТБ даних.Функції
- коротке вирівнювання читання (на основі BWA)
- дубльована ідентифікація прочитаного
- відсортувати прочитане відображення
- розрахувати емпіричні базові таблиці перекалібрування якості
- швидкий, масштабований, надійний (працює на Hadoop)
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
