Це програма Linux під назвою SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster для запуску в Linux онлайн з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
SWAPHI-LS: вирівнювання кластера Xeon Phi для роботи в Linux онлайн
Ad
ОПИС
Перший паралельний алгоритм Сміта-Вотермана, який використовує кластери Intel Xeon Phi для прискорення вирівнювання довгих послідовностей ДНК. Цей алгоритм написаний на C++ (з набором внутрішніх розширень SIMD), OpenMP і MPI. Оцінка продуктивності показала, що наш алгоритм забезпечує дуже стабільну продуктивність і забезпечує продуктивність до 30.1 GCUPS на одному Xeon Phi і до 111.4 GCUPS на чотирьох Xeon Phi, які спільно використовують хост.Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Консоль/Термінал, командний рядок
Мова програмування
C + +
Це програма, яку також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було найпростіше запускати онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
