Це програма для Linux під назвою VIGOR3 для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як VIGOR3.tgz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою VIGOR3, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
VIGOR3 для запуску в Linux онлайн
ОПИС
VIGOR є інструментом для анотування кодуючих генів у вірусних геномах. Його розробили Джеффрі Гувер і Шилянг Ван для Центру інфекційних захворювань JCVI (GSCID).http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
Контакти:
Джефф Гувер
301-540-7858
[захищено електронною поштою]
Функції
- розуміє редагування РНК, рибосомне прослизання, читання стоп-кодона та альтернативні стартові кодони
- анотує зрілі пептиди на поліпротеїнах
- обробляє зрощені, перекриваються та вбудовані гени
- обробляє циркулярні, часткові та чернові (розривні) геноми
- діагностує зсув кадрів у збірці
- включає довідкові набори даних для більш ніж 50 видів
- включає інструменти для створення нових довідкових наборів даних
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Perl
Середовище бази даних
SQLite
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/vigor3/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
