Це програма для Windows під назвою FastQC, останню версію якої можна завантажити як v0.12.1sourcecode.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою FastQC з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
ЕКРАНИ
Ad
Швидкий контроль якості
ОПИС
FastQC — це інструмент аналізу контролю якості, розроблений для виявлення потенційних проблем у наборах даних високопродуктивного секвенування. Його мета — забезпечити простий спосіб перевірки якості необроблених даних послідовності, що надходять із високопродуктивних конвеєрів секвенування. Для цього виконується модульний набір аналізів одного або кількох необроблених файлів послідовності у форматі fastq або bam. Потім створюється звіт, у якому підсумовуються результати та виділяється будь-які області, де бібліотека може здатися незвичною. Тоді це має направити вас туди, де можуть виникнути проблеми з вашими даними, і дозволить вам вжити необхідних заходів, щоб виправити їх, перш ніж робити будь-який подальший аналіз.
FastQC не прив’язаний до якогось конкретного типу техніки секвенування, тому його можна використовувати для перегляду бібліотек різних типів експериментів (геномне секвенування, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq тощо).
риси
- Імпортує дані з файлів BAM, SAM або FastQ
- Пропонує короткий огляд, який висвітлює потенційні проблемні області
- Зведені графіки та таблиці для швидкої оцінки даних
- Експортувати результати в HTML
- Можна використовувати офлайн
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
