Це програма Windows під назвою PyPedal, останню версію якої можна завантажити як PyPedal-2.0.3.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою PyPedal з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
ЕКРАНИ
Ad
PyPedal
ОПИС
PyPedal — це модуль Python, який надає інструменти для маніпуляції родоводів, простої візуалізації родоводів і обчислення показників генетичної різноманітності з родоводів.
Функції
- Читання файлів родоводу у визначених користувачем форматах
- Перевірка цілісності родоводу (дубльовані ідентифікатори, батьки молодші за потомство тощо)
- Створення підсумкової інформації, наприклад частоти появи в родоводі
- Зміна порядку та нумерації файлів родоводу
- Розрахунок чисельної матриці співвідношення (A) з родоводу табличним методом
- Розрахунки інбридингу для великих родоводів
- Розрахунок середніх сумарних та середніх індивідуальних коефіцієнтів інбридингу та спорідненості
- Розрахунок коефіцієнтів часткового інбридингу ітераційним табличним методом (Лейсі, 1996; Гулісія, 2006)
- Розрахунок коефіцієнтів родового інбридингу за методами Ballou (1997) або Suwanlee et al. (2007)
- Розрахунок теоретичної та фактичної ефективної чисельності популяції
- Розрахунок ефективного числа засновника за точним алгоритмом Лейсі
- Розрахунок ефективного числа засновників за наближеним алгоритмом Boichard et al.
- Обчислення ефективного числа предків з використанням алгоритмів Boichard et al.
- Відбір підродоводів, що містять усіх предків тварин
- Визначення спільних родичів двох тварин
- Розрахунок інбридингу потомства від передбачуваного спарювання
- Виведення в текстові файли ASCII, включаючи матриці, коефіцієнти інбридингу та спорідненості, а також підсумкову інформацію
- Імпорт і експорт файлів GEDCOM 5.5
- Імпорт та експорт файлів GENES 1.20 (dBase III).
- Завантаження родоводів із баз даних MySQL, Postgres та SQLite та їх збереження в них
- Моделювання родоводів за допомогою алгоритму, отриманого з Matvec 1.1a
Аудиторія
Освіта, наука/дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Python
Середовище бази даних
MySQL, PostgreSQL (pgsql), SQLite
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/pypedal/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
