This is the command arden-analyze that can be run in the OnWorks free hosting provider using one of our multiple free online workstations such as Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator or MAC OS online emulator
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
arden-analyze - analyze the results of the artificial reference genome mapping
SYNOPSIS
arden-analyze [lựa chọn] [ĐẦU VÀO FILE] [ĐẦU RA] ...
MÔ TẢ
Script to analyze the results of the artificial reference genome mapping. This script
identifies the putative TPs / FPs on a specific data set (reads).
LỰA CHỌN
ĐẦU RA
path to output destination folder.
ĐẦU VÀO FILE
ppath to ini file. To get the required format have a look at the example files.
--phiên bản
hiển thị số phiên bản của chương trình và thoát
-h, --Cứu giúp
hiển thị thông báo trợ giúp này và thoát
-p PHRED, --phred=PHRED
Specify the PHRED encoding of the input reads i.e. Illumina 1.3+ = -p 33.[default:
33]
-r RANK, --internalrank=CẤP
Use internal ranking for reads (needed if the read names cannot be
lexicographically be sorted in the same way in python and your OS by sam
tools).[default:1]
Use arden-analyze online using onworks.net services
