Đây là lệnh asn2fsa có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
asn2fsa - chuyển đổi dữ liệu chuỗi sinh học từ ASN.1 sang FASTA
SYNOPSIS
asn2fsa [-] [-A acc] [-D] [-E] [-H] [-L tên tập tin] [-T] [-a kiểu] [-b] [-c] [-d con đường]
[-e N] [-f con đường] [-g] [-h tên tập tin] [-i tên tập tin] [-k] [-l] [-m] [-o tên tập tin] [-p con đường]
[-q tên tập tin] [-r] [-s] [-u] [-v tên tập tin] [-x str] [-z]
MÔ TẢ
asn2fsa chuyển đổi dữ liệu trình tự sinh học từ ASN.1 sang FASTA.
LỰA CHỌN
Dưới đây là một bản tóm tắt các tùy chọn.
- In tin nhắn sử dụng
-A acc Quyền truy cập để tìm nạp
-D Sử dụng Dash cho Gap
-E Id Seq mở rộng
-H Nhịp HTML
-L tên tập tin
Tệp nhật ký
-T Sử dụng chủ đề
-a kiểu
Nhập loại ASN.1:
a Tự động (mặc định)
khờ dại
e Nhập tuần tự
b Sinh trắc học
s Bioseq-bộ
m Seq-gửi
xử lý hàng loạt t (thích hợp cho các bản phát hành chính thức; tự động phát hiện loại cụ thể)
-b Bioseq-set là Binary
-c Bioseq-set được nén
-d con đường
Đường dẫn đến Cơ sở dữ liệu ReadDB
-e N Độ dài dòng (70 theo mặc định; có thể nằm trong khoảng từ 10 đến 120)
-f con đường
Đường dẫn đến dữ liệu FASTA được lập chỉ mục
-g Mở rộng khoảng trống đồng bằng thành Ns
-h tên tập tin
Tên tệp đầu ra của bộ đệm thành phần xa
-i tên tập tin
Tệp đầu vào đơn (đầu vào tiêu chuẩn theo mặc định)
-k Tìm nạp cục bộ
-l Khóa các thành phần trước
-m Kiểu chính cho các chuỗi được phân đoạn gần
-o tên tập tin
Tên tệp đầu ra nucleotide
-p con đường
Đường dẫn đến tệp ASN.1
-q tên tập tin
Tên tệp đầu ra điểm chất lượng
-r Tìm nạp từ xa từ NCBI
-s Cấu trúc bộ gen xa cho điểm chất lượng
-u tái diễn
-v tên tập tin
Tên tệp đầu ra protein
-x str Chuỗi con lựa chọn tệp (.ent theo mặc định) [Chuỗi]
-z Khoảng cách điểm chất lượng in là -1
Sử dụng asn2fsa trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
