Đây là lệnh bam2fastx có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
bam2fastx - thành phần tophat chuyển đổi bam trực tiếp thành fastx
SYNOPSIS
bam2fastx [--fasta | -a | --fastq | -q] [--màu sắc] [-Q] [--sam | -s | -t]
MÔ TẢ
[-M | - chỉ ánh xạ | -A | - tất cả] [-o ] [-P | - ghép đôi] [-N]
Lưu ý: Theo mặc định, các lần đọc được gắn cờ là không vượt qua các kiểm soát chất lượng
bỏ đi; NS -Q có thể được sử dụng để bỏ qua cờ QC.
Sử dụng -N tùy chọn nếu /1 và /2 hậu tố phải được thêm vào
đọc tên theo các cờ SAM
Sử dụng -O tùy chọn bỏ qua thẻ OQ, nếu có, khi viết giá trị chất lượng
Sử dụng bam2fastx trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
