bp_chaos_plotp - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

bp_chaos_plot - một âm mưu hỗn loạn từ trình tự DNA và RNA

SYNOPSIS

bp_chaos_plot.pl -i / - input = INPUTFILE -f / - format = SEQFORMAT
-o / - output = OUTPUTFILE -g / - graphics = ĐỊNH DẠNG ĐỒ HỌA
-w / - width = WIGHT -h / - height = HEIGHT

MÔ TẢ

Tập lệnh này tạo các tệp hình ảnh bằng cách sử dụng thư viện hình ảnh GD để trực quan hóa nucleotide
trình tự sử dụng cốt truyện hỗn loạn.

LỰA CHỌN

Các định dạng đồ họa hợp lệ hiện là gd, gd2, png, wbmp, jpeg và gif.

Kích thước mặc định của tệp hình ảnh là 600x400.

Đầu vào trình tự có thể được cung cấp bằng cách sử dụng bất kỳ phương pháp nào trong ba phương pháp:

đối số không tên
tên tệp bp_chaos_plot

đối số được đặt tên
tên tệp bp_chaos_plot -i

đầu vào tiêu chuẩn
bp_chaos_plot <tên tệp

PHẢN HỒI

Mailing Chức năng
Phản hồi của người dùng là một phần không thể thiếu trong quá trình phát triển của mô-đun này và các mô-đun Bioperl khác. Gửi
các nhận xét và đề xuất của bạn tốt hơn vào danh sách gửi thư Bioperl. Sự tham gia của bạn
được nhiều đánh giá cao.

[email được bảo vệ] - Thảo luận chung
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Giới thiệu về danh sách gửi thư

Báo cáo Lỗi
Báo cáo lỗi cho hệ thống theo dõi lỗi Bioperl để giúp chúng tôi theo dõi các lỗi và
nghị quyết. Báo cáo lỗi có thể được gửi qua web:

https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues

TÁC GIẢ - Jason Stajich

E-mail [email được bảo vệ]

LỊCH SỬ

Mã này dựa trên mã EMBOSS C dành cho hỗn loạn.c của Ian Longden. Bao gồm
tài liệu từ mã EMBOSS:

Hỗn loạn tạo ra một âm mưu hỗn loạn. Ứng dụng gốc là một phần của bộ gen ACEDB
gói cơ sở dữ liệu, được viết bởi ** Richard Durbin (MRC LMB, Vương quốc Anh) [email được bảo vệ]và
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Pháp) [email được bảo vệ]

Sử dụng bp_chaos_plotp trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net