Đây là cassiopee lệnh có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
cassiopee - trang hướng dẫn sử dụng Cassiopee Phiên bản 1.0
SYNOPSIS
casiopee [Tùy chọn]
MÔ TẢ
Cách sử dụng:
-l: độ sâu chỉ mục tối đa / kích thước mẫu tối đa
-u: lưu chỉ mục để sử dụng sau
-s: trình tự để lập chỉ mục
-p: mẫu để tìm kiếm
-f: tệp chứa mẫu để tìm kiếm
-o: tập tin đầu ra
-r: áp dụng giảm cây
-m: chế độ tìm kiếm: 0 = DNA, 1 = RNA, 2 = Protein
-a: cho phép tìm kiếm sự không rõ ràng trong bảng chữ cái
-n: tối đa N kết quả phù hợp liên tiếp được phép trong tìm kiếm
-e: kết quả phù hợp thay thế tối đa được phép trong tìm kiếm
-i: các kết quả phù hợp tối đa được phép indel trong tìm kiếm
-g: tạo tệp chấm của biểu đồ
-d: độ sâu tối đa của đồ thị
-t: định dạng đầu ra: 0: tsv (mặc định), 1: json
-x: vị trí tối thiểu trong chuỗi
-y: vị trí tối đa trong chuỗi
-v: phiên bản hiển thị
-h: hiển thị thông báo này
Sử dụng cassiopee trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
