cmtk-formatx - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

formatx - Trình định dạng lại âm lượng

SYNOPSIS

định dạng lại [tùy chọn] - hiển thị mục tiêu floatImg x0 [x1 ...]
HOẶC định dạng lại [tùy chọn] target [x0 x1 ...] {-j, - jacobian} xx0 [xx1 ...]
HOẶC TRONG ĐÓ x0 ... xN và xx0 ... xxN là phép biến đổi [{-i, - nghịch đảo}] ##. (Nếu người đầu tiên
phép biến đổi trong chuỗi được đảo ngược, sau đó '--inverse' phải được đặt trước bởi '-',
tức là, sử dụng '- --inverse xform.path').

MÔ TẢ

Công cụ định dạng lại khối lượng mở rộng để tính toán các hình ảnh được định dạng lại và bản đồ Jacobian từ
chuỗi tùy ý của các phép biến đổi nối

LỰA CHỌN

Toàn cầu Toolkit Các lựa chọn (những đang chia sẻ by tất cả các CMTK công cụ)
--Cứu giúp
Viết danh sách các tùy chọn dòng lệnh cơ bản vào đầu ra tiêu chuẩn.

- trợ giúp tất cả
Viết danh sách đầy đủ các tùy chọn dòng lệnh cơ bản và nâng cao vào đầu ra tiêu chuẩn.

--wiki
Viết danh sách các tùy chọn dòng lệnh vào đầu ra tiêu chuẩn trong đánh dấu MediaWiki.

--Đàn ông
Viết nguồn trang người đàn ông trong đánh dấu 'nroff' cho đầu ra tiêu chuẩn.

--phiên bản
Viết phiên bản bộ công cụ ra đầu ra tiêu chuẩn.

--echo
Viết dòng lệnh hiện tại vào đầu ra tiêu chuẩn.

--verbose cấp
Đặt mức độ chi tiết.

--dài dòng, -v
Mức độ chi tiết tăng lên 1 (không dùng nữa; được hỗ trợ cho khả năng tương thích ngược).

--chủ đề
Đặt số lượng luồng song song tối đa (cho luồng POSIX và OpenMP).

--Loại đầu ra
Kiểu dữ liệu vô hướng cho hình ảnh đầu ra. Các giá trị được hỗ trợ: "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double" hoặc sử dụng một trong các cách sau:

--char
8 bit, có dấu

--byte
8 bit, không dấu

--ngắn
16 bit, có dấu

--nguyên tắc
16 bit, không dấu

--NS
32 bit được ký

- gợi ý
32 bit không dấu

--trôi nổi
32 bit dấu phẩy động

--kép
64 bit dấu phẩy động

--Pad ra , -P
Giá trị đệm cho hình ảnh đầu ra [Vỡ nợ: 0]

Các lựa chọn cho Trơn Định dạng lại
- nội suy
Phương pháp nội suy ảnh. Các giá trị được hỗ trợ: "tuyến tính", "nn", "khối", "pv", "sinc-
cosine "," sinc-hamming ", trong đó giá trị mặc định là" tuyến tính "hoặc sử dụng một trong các cách sau:

--tuyến tính
Nội suy ba tuyến [Cái này is các vỡ nợ]

--nn Nội suy người hàng xóm gần nhất

--khối
Nội suy ba ống

--pv Nội suy thể tích từng phần

--sinc-cosin
Phép nội suy Sinc với cửa sổ cosine

--sinc-hamming
Nội suy Sinc với cửa sổ Hamming

--sinc-window-bán kính
Bán kính cửa sổ cho phép nội suy Sinc [Vỡ nợ: 3]

- bảo tồn khối lượng
Định dạng bảo toàn hàng loạt: nhân mọi giá trị được định dạng lại với Jacobian
yếu tố quyết định của phép biến đổi được áp dụng.

Các lựa chọn cho Giacôbê Bản đồ Định dạng lại
--jacobian-đúng-toàn cầu
Bản đồ Jacobian chính xác cho quy mô toàn cầu.

--no-jacobian-đúng-toàn cầu
Không sửa bản đồ Jacobian cho quy mô toàn cầu. [Cái này is các vỡ nợ]

Đầu vào Các lựa chọn
- lưới mục tiêu
Xác định lưới mục tiêu để định dạng lại là Nx, Ny, Nz: dX, dY, dZ [: Ox, Oy, Oz]
(dims: pixel: offset)

--mặt nạ, -m
Sử dụng dữ liệu pixel mục tiêu dưới dạng mặt nạ nhị phân.

--trồng trọt
Cắt hình ảnh mục tiêu: x0, y0, z0, x1, y1, z2

- mục tiêu-bù đắp , -O
Ghi đè bù đắp hình ảnh mục tiêu và đặt thành x, y, z mm

--target-offset-pixel
Ghi đè bù đắp hình ảnh mục tiêu và đặt thành pixel dx, dy, dz

--nổi , -F
Định dạng và đường dẫn của hình ảnh nổi. [Vỡ nợ: KHÔNG AI]

--pad-nổi
Giá trị đệm cho hình ảnh nổi [Vỡ nợ: Vô hiệu hóa]

Đầu ra Các lựa chọn
--outfile , -o
Định dạng và đường dẫn của hình ảnh đầu ra. [Vỡ nợ: format.nii ]

Hình ảnh / Chuyển đổi Cơ sở dữ liệu
--db
Đường dẫn đến cơ sở dữ liệu chuyển đổi / hình ảnh cần được cập nhật với cơ sở dữ liệu mới được tạo
hình ảnh. [Vỡ nợ: KHÔNG AI]

TÁC GIẢ

Torsten Rohlfing, với sự đóng góp của Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B.Russakoff và Yaroslav Halchenko

Sử dụng cmtk-formatx trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net