cmtk-unwarp_image_phantom - Trực tuyến trên Đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

unwarp_image_phantom - Tạo phép biến đổi để làm mờ một hình ảnh dựa trên một bóng ma
Mô tả

SYNOPSIS

unwarp_image_phantom InputPhantom Đầu vào Hình ảnh Đầu raXform

MÔ TẢ

Công cụ này tính toán phép biến đổi đa thức hoặc phép biến dạng dạng tự do B-spline thành
mở rộng một hình ảnh. Sự chuyển đổi dựa trên các mốc dự kiến ​​và được phát hiện trong một
hình ảnh của một bóng ma cấu trúc thu được trên cùng một máy quét. Sử dụng 'explore_adni_phantom'
công cụ để phát hiện các điểm mốc của ADNI Phantom trong một hình ảnh và tạo ra một bóng ma
tệp mô tả phù hợp để sử dụng với công cụ này.

LỰA CHỌN

Toàn cầu Toolkit Các lựa chọn (những đang chia sẻ by tất cả các CMTK công cụ)
--Cứu giúp
Viết danh sách các tùy chọn dòng lệnh cơ bản vào đầu ra tiêu chuẩn.

- trợ giúp tất cả
Viết danh sách đầy đủ các tùy chọn dòng lệnh cơ bản và nâng cao vào đầu ra tiêu chuẩn.

--wiki
Viết danh sách các tùy chọn dòng lệnh vào đầu ra tiêu chuẩn trong đánh dấu MediaWiki.

--Đàn ông
Viết nguồn trang người đàn ông trong đánh dấu 'nroff' cho đầu ra tiêu chuẩn.

--phiên bản
Viết phiên bản bộ công cụ ra đầu ra tiêu chuẩn.

--echo
Viết dòng lệnh hiện tại vào đầu ra tiêu chuẩn.

--verbose cấp
Đặt mức độ chi tiết.

--dài dòng, -v
Mức độ chi tiết tăng lên 1 (không dùng nữa; được hỗ trợ cho khả năng tương thích ngược).

--chủ đề
Đặt số lượng luồng song song tối đa (cho luồng POSIX và OpenMP).

Lắp Các lựa chọn
--fit-nghịch đảo
Điều chỉnh phép biến đổi nghịch đảo (ánh xạ thực tế với các vị trí mốc dự kiến). Đây là
hữu ích để tính toán một bản đồ hiệu chỉnh âm lượng Jacobian (sử dụng 'formatatx') mà không
phải đảo ngược về mặt số học của phép biến đổi unwarping vừa vặn.

--phù hợp về phía trước
Điều chỉnh chuyển đổi về phía trước (ánh xạ dự kiến ​​đến các vị trí mốc thực tế). Đây là
hữu ích để chỉnh sửa hình ảnh thông qua việc tái tạo lại (sử dụng 'formatatx'). [Cái này is các
vỡ nợ]

Chuyển đổi mô hình
--spline
Phù hợp với biến dạng tự do B-spline.

--poly
Phép biến đổi đa thức phù hợp. [Cái này is các vỡ nợ]

Đa thức Lắp Các lựa chọn (với --poly)
--trình độ
Mức độ của phép biến đổi đa thức vừa vặn. [Vỡ nợ: 4]

B-Spline Lắp Các lựa chọn (với --spline)
--cuối cùng-cp-spacing
Khoảng cách lưới điểm điều khiển cuối cùng của phép biến đổi B-spline đầu ra. [Vỡ nợ: 0]

--cuối cùng-cp-dims
Kích thước lưới điểm điều khiển cuối cùng (tức là số lượng điểm điều khiển) của đầu ra B-
phép biến đổi spline. Được cung cấp dưới dạng 'dimX, dimY, dimZ'. [Vỡ nợ: KHÔNG AI]

- cấp độ
Số cấp trong quy trình xấp xỉ B-spline nhiều cấp. [Vỡ nợ: 1]

--itrations-per-level
Số lần lặp lại cập nhật hệ số spline tối đa cho mỗi cấp trong đa cấp
Quy trình xấp xỉ B-spline. [Vỡ nợ: 100]

--rms-ngưỡng
Ngưỡng cải thiện tương đối lượng dư phù hợp RMS. Sự lặp lại phù hợp
chấm dứt nếu (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate) / rmsBeforeUpdate <ngưỡng.
[Vỡ nợ: 0]

--no-fit-affine
Tắt sự phù hợp của phép biến đổi affine để khởi tạo spline. Thay vào đó, hãy lắp spline
trực tiếp. Điều này thường cho kết quả tồi tệ hơn và không được khuyến khích.

TÁC GIẢ

Torsten Rohlfing, với sự đóng góp của Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B.Russakoff và Yaroslav Halchenko

Sử dụng cmtk-unwarp_image_phantom trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net