Đây là lệnh EDTSurf có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
EDTSurf - xây dựng nhanh chóng và chính xác các bề mặt đại phân tử
SYNOPSIS
EDSurf -i tên pdb ...
MÔ TẢ
EDTSurf là một chương trình mã nguồn mở để xây dựng các bề mặt tam giác cho các đại phân tử. Nó
tạo ra ba bề mặt đại phân tử chính: bề mặt van der Waals, có thể tiếp cận với dung môi
bề mặt và bề mặt phân tử (bề mặt loại trừ dung môi). EDTsurf cũng xác định sâu răng
nằm bên trong các đại phân tử.
LỰA CHỌN
-o tên riêng
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-chuỗi 2 nguyên tử 3 tinh khiết
-p bán kính thăm dò [0,2.0]
-f hệ số tỷ lệ (0,20.0]
-h 1-in và out 2-out 3-in
đầu ra1: outname.ply
đầu ra2: outname.asa
đầu ra3: tên ngoài-cav.pdb
Sử dụng EDTSurf trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
