Đây là lệnh gt-readjoiner-assembly có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gt-readjoiner-assembly - Xây dựng đồ thị chuỗi và đồ thị đầu ra.
SYNOPSIS
gt người đọc lắp ráp [Lựa chọn ...]
MÔ TẢ
-readset [chuỗi]
chỉ định tên bộ đọc (mặc định: không xác định)
-spmfiles [giá trị]
số lượng tệp SPM để đọc cái này phải bằng giá trị của -j cho phần chồng chéo
pha (mặc định: 1)
-l [giá trị]
chỉ định độ dài SPM tối thiểu (mặc định: 0)
-độ sâu [giá trị]
chỉ định số lượng nút tối thiểu trong một contig (mặc định: 3)
-chiều dài cắt [giá trị]
chỉ định độ dài tối thiểu của một đường viền (mặc định: 100)
-srors [có | không]
các tính năng biểu đồ tìm kiếm có thể bắt nguồn từ lỗi trình tự và loại bỏ chúng
(mặc định: không)
-bong bóng [giá trị]
số vòng loại bỏ bong bóng p cần thực hiện (mặc định: 3)
-ngõ cụt [giá trị]
số vòng loại bỏ ngõ cụt để thực hiện ngõ cụt (mặc định: 10)
-deadend-độ sâu [giá trị]
chỉ định độ sâu tối đa của một đường dẫn đến đỉnh cuối mà đường dẫn sẽ là
được coi là một ngõ cụt (mặc định: 10)
-v [có | không]
dài dòng (mặc định: không)
-q [có | không]
ngăn chặn các thông báo đầu ra tiêu chuẩn (mặc định: không)
-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp cho các tùy chọn cơ bản và thoát
-help +
hiển thị trợ giúp cho tất cả các tùy chọn và thoát
-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát
BÁO CÁO GIỎI
Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.
Sử dụng gt-readjoiner-assembly trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
