Đây là lệnh gt-stat có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gt-stat - Hiển thị số liệu thống kê về các tính năng có trong tệp GFF3.
SYNOPSIS
gt stat [tùy chọn ...] [GFF3_file ...]
MÔ TẢ
-genelengthdistri [có | không]
hiển thị phân bố chiều dài gen (mặc định: không)
-genescoredistri [có | không]
hiển thị phân bố điểm gen (mặc định: không)
-exonlengthdistri [có | không]
hiển thị phân bố độ dài exon (mặc định: không)
-exonnumberdistri [có | không]
hiển thị phân bố số exon (mặc định: không)
-intronlengthdistri [có | không]
hiển thị phân bố chiều dài intron (mặc định: không)
-cdslengthdistri [có | không]
hiển thị phân bố chiều dài CDS (được đo bằng axit amin) (mặc định: không)
-Source [có | không]
hiển thị tập hợp các thẻ nguồn đã sử dụng (cột 2 trong các dòng GFF3 thông thường) (mặc định: không)
-addintron [có | không]
thêm các tính năng intron giữa các tính năng exon hiện có (trước khi tính toán số liệu thống kê) (mặc định:
không)
-v [có | không]
dài dòng (mặc định: không)
-o [tên tập tin]
chuyển hướng đầu ra đến tệp được chỉ định (mặc định: không xác định)
-gzip [có | không]
ghi tệp đầu ra nén gzip (mặc định: không)
-bzip2 [có | không]
ghi tệp đầu ra nén bzip2 (mặc định: không)
-lực lượng [có | không]
buộc ghi vào tệp đầu ra (mặc định: không)
-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp và thoát
-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát
BÁO CÁO GIỎI
Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.
Sử dụng gt-stat trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
