Đây là lệnh LAshow có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
LAshow - hiển thị các căn chỉnh cục bộ từ các tệp .las
SYNOPSIS
LAshow [-caroUF] [-iint(4)] [-wint(100)][-bint(10)] src1: db | dam [src2: db | dam] căn chỉnh: las
[đọc: FILE | đọc: phạm vi ...]
MÔ TẢ
LAshow tạo ra một danh sách in về các căn chỉnh cục bộ có trong .las được chỉ định
tệp, nơi đọc a- và b-bắt nguồn từ src1 hoặc từ src1 và src2, tương ứng. Nếu một
tệp hoặc danh sách các phạm vi đọc được cung cấp, sau đó chỉ các phần chồng chéo mà a-read nằm trong
tập hợp được chỉ định bởi tệp hoặc danh sách được hiển thị. Nhìn thấy DBshow(1) để giải thích về
cách tệp và danh sách các phạm vi đọc được diễn giải.
LỰA CHỌN
-F Đảo ngược vai trò của các lần đọc a- và b- trong màn hình
-U Sử dụng chữ hoa cho chuỗi DNA thay vì chữ thường mặc định
-ithụt đầu dòng
Đặt thụt lề cho hoạt hình và / hoặc hiển thị căn chỉnh nếu chúng được yêu cầu.
(mặc định: 4)
-bsố_ký hiệu
Đặt số lượng ký hiệu ở hai bên của các đoạn được căn chỉnh trong một căn chỉnh
trưng bày. (mặc định: 10)
-ww Tham số này được sử dụng cho các chế độ hiển thị được chỉ định bởi -a và -r. (vỡ nợ:
100)
-o Chỉ hiển thị các căn chỉnh trùng lặp phù hợp - nghĩa là nơi một trình tự kết thúc
xảy ra ở mỗi đầu của việc căn chỉnh
DISPLAY CHẾ ĐỘ
-c Vẽ hoạt hình của sự liên kết
-một, -r Hiển thị sự liên kết của căn chỉnh cục bộ
Sản phẩm -a tùy chọn đặt chính xác w các cột trên mỗi phân đoạn của màn hình, trong khi -r tùy chọn
đặt chính xác w a-đọc ký hiệu trong mỗi phân đoạn của màn hình. Các -r chế độ hiển thị là
hữu ích khi một người muốn so sánh trực quan hai căn chỉnh liên quan đến cùng một lần đọc. Nếu một
sự kết hợp của -c, -avà -r cờ được đặt, sau đó phim hoạt hình xuất hiện trước, sau đó -a
sự liên kết, và cuối cùng là -r căn chỉnh.
Sử dụng LAshow trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
