maskfeate - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

maskfeat - Viết một chuỗi với các tính năng bị che

SYNOPSIS

mặt nạ -sự nối tiếp tiếp theo [-kiểu chuỗi] [-tháp bật lên] -mặt nạ chuỗi -outseq phần tiếp theo

mặt nạ -Cứu giúp

MÔ TẢ

mặt nạ là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Chỉnh sửa, Bảng tính năng".

LỰA CHỌN

Đầu vào phần
-sự nối tiếp tiếp theo

thêm vào phần
-kiểu chuỗi
Theo mặc định, bất kỳ tính năng nào trong bảng tính năng có kiểu bắt đầu 'lặp lại' sẽ bị che.
Bạn có thể đặt đây là bất kỳ loại tính năng nào bạn muốn che. Nhìn thấy
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ để biết danh sách các loại tính năng EMBL và xem
Phụ lục A của hướng dẫn sử dụng Swissprot trong http://www.expasy.org/sprot/userman.html
để biết danh sách các loại tính năng Swissprot. Loại có thể được ký tự đại diện bằng cách sử dụng '*'. Nếu như
bạn muốn che dấu nhiều loại, hãy phân tách tên của chúng bằng dấu cách hoặc dấu phẩy, ví dụ:
* UTR lặp lại * Giá trị mặc định: lặp lại *

-tháp bật lên
Khu vực có thể được 'che dấu' bằng cách chuyển đổi các ký tự trình tự thành chữ thường, một số
các chương trình không phải EMBOSS, ví dụ như fasta có thể hiểu đây là một vùng bị che. Trình tự là
không thay đổi ngoài trường hợp thay đổi. Bạn có thể muốn đảm bảo rằng toàn bộ chuỗi
là chữ hoa trước khi che các vùng được chỉ định thành chữ thường bằng cách sử dụng
cờ '-supper'. Giá trị mặc định: N

-mặt nạ chuỗi
Nhân vật sử dụng khi tạo mặt nạ. Mặc định là 'X' cho trình tự protein, 'N' cho nucleic
trình tự. Nếu ký tự mặt nạ được đặt thành ký tự SPACE hoặc ký tự rỗng,
sau đó trình tự được 'che dấu' bằng cách thay đổi nó thành chữ thường, giống như với
cờ 'chữ hoa'. Giá trị mặc định: @ ($ (acdprotein)? X: N)

Đầu ra phần
-outseq phần tiếp theo

Sử dụng maskfeate trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net