Đây là lệnh xplor2gmx có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
xplor2gmx - Chuyển đổi giới hạn khoảng cách XPLOR sang định dạng Gromacs
SYNOPSIS
xplor2gmx (phần còn lại bù lại) đầu vào.pdb
MÔ TẢ
xplor2gmx đọc tệp đầu vào XPLOR với dữ liệu giới hạn khoảng cách như đôi khi được tìm thấy trong
cơ sở dữ liệu pdb (http://www.pdb.org). Từ tập tin đầu vào này, các số còn lại nhị diện sẽ được
loại bỏ, sao cho chỉ còn lại các giới hạn khoảng cách. Tập lệnh có thể xử lý không rõ ràng
những hạn chế. Nó chuyển đổi giới hạn khoảng cách sang định dạng GROMACS.
Tệp hạn chế (.dat) phải được cung cấp trên STDIN và tệp đầu ra phù hợp (.itp) là
được gửi đến STDOUT.
VÍ DỤ
xplor2gmx.pl 33 conf.pdb <Restints.dat> disre.itp
LỰA CHỌN
xplor2gmx yêu cầu hai tùy chọn dòng lệnh: đầu tiên, phần bù dư (số nguyên); thứ hai,
tên tệp .pdb. Tệp pdb phải có số nguyên tử chính xác.
Sử dụng xplor2gmx trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net