Đây là ứng dụng Linux có tên ChIP-RNA-seqPRO để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng cloudclientID.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên ChIP-RNA-seqPRO để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
ChIP-RNA-seqPRO để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
ChIP-RNA-seqPRO: Một chiến lược để xác định các vùng của bãi bỏ điều tiết biểu sinh liên quan đến các vị trí nối bản mã sai và các vị trí chỉnh sửa RNA. Các tập lệnh python runnable được đóng gói cùng với thư viện chú thích tùy chỉnh, đầu vào dữ liệu demo và hướng dẫn README.9/26: v1.1 Đã cập nhật MAIN_IV để gỡ lỗi do pandas python không còn hỗ trợ 'tập con' nữa.
Mã này sẽ không còn được duy trì / cập nhật tích cực tại đây. Tài nguyên dựa trên đám mây để phân tích so sánh các bộ dữ liệu biểu sinh, biến thể trình tự và biểu thức hiện đã có sẵn. Vui lòng truy cập Cloudomics, dự án dành cho các tài nguyên dựa trên đám mây: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Tính năng
- Công cụ để phân tích so sánh nhiều bộ dữ liệu mẫu được ghép nối theo trình tự biểu sinh (ChIPseq, MBDseq, v.v.) và dựa trên RNA
- Nếu bạn sử dụng công cụ này hoặc bất kỳ thư viện chú thích nào, vui lòng bao gồm tài liệu tham khảo sau: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. và H. Hồ T. (2015). Các chiến lược tin sinh học để xác định các khu vực bãi bỏ điều tiết biểu sinh liên quan đến nối phiên mã Aberrant và chỉnh sửa RNA. Trong Kỷ yếu của Hội nghị Quốc tế về Mô hình, Phương pháp và Thuật toán Tin sinh học, trang 163-170. DOI: 10.5220 / 0005248001630170
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Vỏ Unix, Python
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
