Đây là ứng dụng Linux có tên CTK, phiên bản mới nhất có thể tải xuống dưới dạng Phiên bản 1.1.5sourcecode.tar.gz. Ứng dụng có thể chạy trực tuyến trên nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks dành cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên CTK với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
CTK
MÔ TẢ
CTK (CLIP Tool Kit) là một bộ công cụ sinh học tính toán được triển khai bằng Perl, được thiết kế để phân tích dữ liệu giải trình tự CLIP. Nó cung cấp một quy trình hợp lý từ các lần đọc thô đến việc gọi đỉnh và khám phá mô-típ.
Tính năng
- Phân tích cú pháp các lần đọc CLIP-seq thô và thực hiện lọc chất lượng
- Xác định các vị trí đột biến gây ra liên kết chéo (CIMS)
- Phát hiện các vùng và đỉnh mô-típ RNA được làm giàu
- Đầu ra định dạng BED/narrowPeak được chuẩn hóa
- Có thể mở rộng thông qua các tập lệnh Perl (ví dụ: tag2cluster, tag2collapse)
- Tài liệu toàn diện và nhóm hỗ trợ người dùng tích cực
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tải xuống từ https://sourceforge.net/projects/ctk.mirror/. Ứng dụng này được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến dễ dàng nhất từ một trong những Hệ điều hành miễn phí của chúng tôi.
