Đây là ứng dụng Linux có tên EigenMS để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng EigenMS.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên EigenMS này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
EigenMS để chạy trong Linux trực tuyến
Ad
MÔ TẢ
EigenMS là một phương pháp chuẩn hóa được thực hiện trong R (và phiên bản cũ hơn trong Matlab) có sẵn dưới dạng một tập hợp hai hàm nên được sử dụng theo một trình tự.Vui lòng tải xuống tệp EigenMS.zip (phiên bản mới nhất).
Phiên bản mới nhất được tải lên vào tháng 2017 năm XNUMX có một bản sửa lỗi để chuẩn hóa nhóm điều trị duy nhất.
Thay đổi quy mô đã bị bỏ qua từ năm 2015.
EigenMS sử dụng SVD để phát hiện các xu hướng sai lệch trong dữ liệu và loại bỏ chúng. EigenMS loại bỏ các tác động từ các yếu tố đã biết và chưa biết và có thể được sử dụng cho bất kỳ nền tảng -omic nào.
Chúng tôi đã chỉ ra tiện ích của nó trong LC-MS / MS và các chất chuyển hóa trong hai bài báo sau:
1) PMID: 19602524. "Bình thường hóa cường độ đỉnh trong proteomics dựa trên MS từ dưới lên bằng cách sử dụng phân hủy giá trị đơn lẻ".
Karpievitch YV, Taverner T, Adkins JN, Callister SJ, Anderson GA, Smith RD, Dabney AR.
Tin sinh học 2009
2) "Chuẩn hóa dữ liệu chuyển hóa với EigenMS"
Karpievitch YV, Nikolic SB, Wilson R, Sharman JE, Edwards LM.
PLoS One 2014
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
MATLAB, S / R
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/eigenms/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
