Đây là ứng dụng Linux có tên Hamstr có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Hamstr này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
chuột đồng
Ad
MÔ TẢ
HaMStR đã chuyển sang https://github.com/bionf/hamstr nơi nó hiện là một phần của gói HaMStR-OneSeq.
HaMStR là một công cụ dựa trên mô hình Markov ẩn hồ sơ để tìm kiếm trực tiếp có hướng trong EST hoặc dữ liệu trình tự protein. Chương trình lấy một nhóm cốt lõi được xác định trước của các trình tự trực giao (core ortholog) và một tập hợp các trình tự từ một đơn vị phân loại tìm kiếm làm đầu vào. Sau đó, HaMStR kết hợp theo chiến lược hai bước là tìm kiếm dựa trên pHMM và tìm kiếm ngược thông qua BLAST để mở rộng nhóm ortholog cốt lõi với các trình tự mới từ đơn vị phân loại tìm kiếm.
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Categories
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/hamstr/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
