Đây là ứng dụng Linux có tên Bộ xử lý dữ liệu dạng bảng thông lượng cao có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng htdpinstaller.exe. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Bộ xử lý dữ liệu dạng bảng thông lượng cao này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Bộ xử lý dữ liệu dạng bảng thông lượng cao
MÔ TẢ
BỘ XỬ LÝ DỮ LIỆU BẢNG HIỆU CAO CẤP (HTDP) là ứng dụng Java nhằm hỗ trợ các tác vụ thăm dò và giảm dữ liệu trong các tệp văn bản lớn do công nghệ thông lượng cao, ví dụ như giải trình tự song song hàng loạt hoặc vi mảng. Phần mềm này đã được tối ưu hóa cho dữ liệu giải trình tự song song và microarray, tuy nhiên, nó có thể chấp nhận bất kỳ tập dữ liệu dạng bảng nào được phân tách bằng ký tự. HTDP cũng có thể nhập, xử lý và chuyển đổi các tệp Định dạng Cuộc gọi Biến thể (VCF) ver. 4.0, 4.1 và 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP cung cấp chức năng lọc nhanh và có thể xử lý dữ liệu bao gồm một hoặc nhiều tệp đầu vào.
Trích dẫn: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Bộ xử lý dữ liệu dạng bảng thông lượng cao - Công cụ đồ họa độc lập với nền tảng để xử lý các tập dữ liệu lớn. PLoS ONE 13 (2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Tính năng
- hoạt động trên bất kỳ dữ liệu cột nào được phân tách bằng ký tự (ví dụ: BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- hợp nhất các tệp dữ liệu dạng bảng theo chiều dọc và chiều ngang
- hợp nhất bất kỳ tệp dữ liệu dạng bảng nào bằng cách sử dụng vị trí bộ gen hoặc (các) cột chung
- khả năng lọc và giảm dữ liệu không giới hạn
- các tệp khác nhau liên quan đến định dạng và nội dung có thể được phân tích cùng một lúc
Ngôn ngữ lập trình
Java
Categories
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/htdp/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.