Đây là ứng dụng Linux có tên misc genomics tools có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng misc_genomics_tools_v0.2.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên là công cụ genomics misc này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
công cụ genomics misc
MÔ TẢ
Đây là một tập hợp các chương trình khác nhau được phát triển trong quá trình của một dự án gen, liên quan đến chủng Pseudomonas NCIMB10586
Bao gồm các
* xác định và sửa chữa các lỗi trong trình tự bộ gen pacbio (ví dụ) bằng cách sử dụng đèn chiếu sáng
* trình tự sinh vật nhân sơ / chú thích bộ gen
* Phân tích RNAseq - chuẩn hóa và đối chiếu nhiều mẫu thành một nhóm
* Hình ảnh hóa RNAseq
Tất cả các tập lệnh được cung cấp trên cơ sở 'nỗ lực cao nhất', tuy nhiên do các thay đổi hệ thống khác nhau, tôi không đảm bảo rằng tất cả các tệp đều là phiên bản được sử dụng trong phân tích.
Ngoài ra, xin lưu ý rằng những điều này đã được phát triển rất nhiều với tính chất hiệu quả - nghĩa là, quá trình này dự kiến sẽ được thực hiện ở dạng cuối cùng một lần; ít quan tâm đến việc tối ưu hóa thời gian chạy hoặc chuỗi các tập lệnh lại với nhau và đôi khi các tài nguyên bên ngoài được truy cập theo cách thủ công.
Tính năng
- Sửa lỗi trình tự gen
- Chú thích trình tự sinh vật nhân sơ
- Chuẩn hóa RNAseq của nhiều mẫu như một nhóm
- Hình ảnh hóa chuỗi mẫu RNAseq / khóa học thời gian
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
