Đây là ứng dụng Linux có tên RNAseqR có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là RNAseqR_1.1.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên RNAseqR này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
RNAseqR
MÔ TẢ
RNAseqR được thiết kế để phân tích biểu hiện của dữ liệu RNA-seq và phù hợp nhất để phân tích nhiều thư viện không giải mã. Nó là một chương trình mã hóa C ++ hiện được biên dịch cho các hệ thống Linux.
Với giao diện GUI và dòng lệnh, nó có thể thực hiện các phép biến đổi nhật ký, PPM và / hoặc RPKM (nếu độ dài được cung cấp), cũng như phân tích thống kê cho biểu thức vi phân, sử dụng hàm phân phối tích lũy nhị thức âm (CDF) hoặc thống kê kiểm tra R được giới thiệu cho phân tích EST bởi Stekel, et al.
Đầu ra cho phép đưa ra quyết định dựa trên xác suất CDF, giá trị R hàng đầu hoặc so sánh giá trị R với dữ liệu ngẫu nhiên. Các phép so sánh là thước đo độ tin cậy của Stekel và cộng sự, hoặc quan sát được so với R mong đợi tại một biểu thức trung bình nhất định. Ngẫu nhiên hóa thông qua Poisson hoặc phân phối nhị thức âm, hoặc xáo trộn cột.
Ngôn ngữ lập trình
C + +
Categories
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.