Đây là ứng dụng Linux có tên SOAPdenovo2 có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới tên SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên SOAPdenovo2 này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
SOAPdenovo2
Ad
MÔ TẢ
Điều gì tiếp theo của SOAPdenovo2:
MEGAHIT là người kế nhiệm chính thức của SOAPdenovo2
MEGAHIT: Một giải pháp nút đơn cực nhanh để lắp ráp hệ mét phức tạp và lớn thông qua đồ thị ngắn gọn de Bruijn
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Mã mới nhất trên GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo là một phương pháp lắp ráp đọc ngắn mới lạ có thể tạo một bản lắp ráp bản nháp de novo cho các bộ gen có kích thước như con người. Chương trình được thiết kế đặc biệt để tập hợp các bài đọc ngắn của Illumina. Nó tạo ra cơ hội mới để xây dựng trình tự tham chiếu và thực hiện phân tích chính xác các bộ gen chưa được khám phá theo cách hiệu quả về chi phí. SOAPdenovo2 là sự kế thừa của SOAPdenovo. Trích dẫn bài báo được xuất bản trên GigaScience (xem trang web bên dưới) nếu bạn muốn trích dẫn SOAPdenovo2.
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Nhà phát triển
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
C ++, C
Môi trường cơ sở dữ liệu
Tập tin phẳng
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
