Đây là ứng dụng Linux có tên SWAPHI: Smith-Waterman trên Intel Xeon Phi có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng swaphi-v1.0.5.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên SWAPHI: Smith-Waterman này trên Intel Xeon Phi với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
SWAPHI: Smith-Waterman trên Intel Xeon Phi
Ad
MÔ TẢ
Thuật toán song song đầu tiên để tăng tốc tìm kiếm cơ sở dữ liệu protein Smith-Waterman trên nhiều bộ xử lý đồng bộ xử lý Intel Xeon Phi được chia sẻ trên máy chủ. Bằng cách tìm kiếm dựa trên cơ sở dữ liệu UniProtKB / TrEMBL, SWAPHI đạt được hiệu suất lên đến 58.8 tỷ lần cập nhật ô mỗi giây (GCUPS) trên một Xeon Phi và lên đến 228.4 GCUPS trên bốn Xeon Phi.
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Giáo dục, Kỹ thuật
Giao diện người dùng
.NET / Mono, Bảng điều khiển / Thiết bị đầu cuối
Ngôn ngữ lập trình
C ++, ALGOL 68
Categories
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/swaphi/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.