Đây là ứng dụng Windows có tên BLAST Ring Image Generator có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng BRIG-0.95-dist.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên BLAST Ring Image Generator với OnWorks này miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động bất kỳ trình giả lập trực tuyến OS OnWorks nào từ trang web này, nhưng trình giả lập trực tuyến Windows tốt hơn.
- 5. Từ Hệ điều hành Windows OnWorks bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng và cài đặt nó.
- 7. Tải xuống Wine từ kho phần mềm phân phối Linux của bạn. Sau khi cài đặt, bạn có thể nhấp đúp vào ứng dụng để chạy chúng với Wine. Bạn cũng có thể thử PlayOnLinux, một giao diện đẹp mắt trên Wine sẽ giúp bạn cài đặt các chương trình và trò chơi phổ biến của Windows.
Wine là một cách để chạy phần mềm Windows trên Linux, nhưng không cần Windows. Wine là một lớp tương thích Windows mã nguồn mở có thể chạy các chương trình Windows trực tiếp trên bất kỳ máy tính để bàn Linux nào. Về cơ bản, Wine đang cố gắng triển khai lại đủ Windows từ đầu để nó có thể chạy tất cả các ứng dụng Windows đó mà không thực sự cần đến Windows.
MÀN HÌNH
Ad
Trình tạo hình ảnh vòng BLAST
MÔ TẢ
BRIG là một ứng dụng đa nền tảng (Windows / Mac / Unix) có thể hiển thị so sánh vòng tròn giữa một số lượng lớn bộ gen, tập trung vào việc xử lý dữ liệu lắp ráp bộ gen.Vui lòng trích dẫn bài báo BRIG nếu BRIG được sử dụng để tạo số liệu cho các ấn phẩm: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): so sánh bộ gen prokaryote đơn giản, BMC Genomics, 12: 402. PMID: 21824423
Tính năng
- Hình ảnh cho thấy sự giống nhau giữa chuỗi tham chiếu trung tâm và các chuỗi khác dưới dạng các vòng đồng tâm.
- BRIG sẽ thực hiện tất cả các so sánh BLAST và phân tích cú pháp tệp tự động thông qua GUI đơn giản.
- Ranh giới khung và phạm vi đọc có thể được hiển thị cho các bộ gen dự thảo; đồ thị tùy chỉnh và chú thích có thể được hiển thị.
- Sử dụng tập hợp gen do người dùng xác định làm đầu vào, BRIG có thể hiển thị sự hiện diện của gen, không có, cắt bớt hoặc biến thể trình tự trong một tập hợp các bộ gen hoàn chỉnh, bộ gen dự thảo hoặc thậm chí dữ liệu trình tự thô, chưa được lắp ráp.
- BRIG cũng chấp nhận các tệp ánh xạ đọc được định dạng SAM cho phép các vùng gen có trong dữ liệu trình tự chưa được lắp ráp từ nhiều mẫu được so sánh đồng thời
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Java
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/brig/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
