这是名为 Molly.jl 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 v0.22.3sourcecode.tar.gz。它可以在免费的工作站托管服务提供商 OnWorks 上在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行此名为 Molly.jl 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
莫莉.jl
商品描述
许多科学现象可以用分子的运动和相互作用来解释。分子动力学 (MD) 是一种用于探索这些现象的计算技术,涵盖从稀有气体到生物大分子的各种现象。Molly.jl 是一个纯 Julia 语言包,用于 MD 计算,并更广泛地用于模拟物理系统。该包已在 2023 年酶大会 (Enzyme Conference 2022) 的一次演讲以及 2023 年 JuliaCon 的 JuliaMolSim 小型研讨会的一次演讲中进行了介绍。XNUMX 年 XNUMX 月的教程幻灯片也已发布。
功能
- 非键相互作用
- 键合相互作用
- 界面允许定义新的交互、模拟器、恒温器、邻居查找器、记录器等。
- Verlet、速度 Verlet、Störmer-Verlet、灵活的 Langevin 和 Nosé-Hoover 积分器
- Andersen、Berendsen 和速度重新调整恒温器
- 周期性、三斜和无限边界条件
- 灵活的记录器可在整个模拟过程中跟踪任意属性
程式语言
朱莉娅
分类
此应用程序也可从 https://sourceforge.net/projects/molly-jl.mirror/ 获取。它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最便捷的方式在线运行。