这是命令 bam2fastx 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
bam2fastx - tophat 组件将 bam 直接转换为 fastx
概要
巴姆2fastx [--fasta|-a|--fastq|-q[- 颜色[-Q[--山姆|-s|-t]
商品描述
[-M|--mapped-only|-A|--all] [-o ] [-P|--配对] [-N]
注意:默认情况下,标记为未通过质量控制的读数是
丢弃; 这 -Q 选项可用于忽略 QC 标志。
使用 -N 选项,如果 /1 和 /2 后缀应该附加到
根据 SAM 标志读取名称
使用 -O 在写入质量值时忽略 OQ 标签的选项(如果存在)
使用 onworks.net 服务在线使用 bam2fastx