这是 bp_process_sgdp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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bp_process_sgd.pl - 将 SGD 注释平面文件添加到适合
通用基因组浏览器
概要
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > 酵母.gff
商品描述
此脚本处理位于以下位置的 SGD 序列注释平面文件
ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/data_dump/feature/chromosomal_features.tab 成
适合通用基因组浏览器显示的 GFF 格式版本。
要使用此脚本,请从列出的 FTP 站点获取 SGD chromosomal_features.tab 文件
上面,然后运行以下命令:
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > 酵母.gff
然后可以使用以下命令将酵母.gff 文件加载到 Bio::DB::GFF 数据库中
命令:
%bulk_load_gff.pl -d 酵母.gff
使用 onworks.net 服务在线使用 bp_process_sgdp