这是 bp_seqretp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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bp_seqret - bioperl 实现从本地数据库获取序列(如 EMBOSS seqret)
用法
bp_seqret [-f/--format 输出格式] [-o/--out/--outfile 输出文件] [-d/--db dbname]
[-i/--id/-s/--seqname seqname1]
用法示例:
bp_seqret -f fasta -db db.fa -i seq1 -i seq2 > output.fas
bp_seqret db.fa:seq1 输出.fas
bp_seqret db.fa:seq1 -o 输出.fas
bp_seqret -db db.fa -o 输出.fas seq1 seq2 seq3
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 输出.fas
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 - > output.fas
DB 预计是具有多个序列的 Fasta 格式的序列文件。
默认输出格式为 Fasta。
如果未提供输出文件名,则输出将写入 STDOUT。 提供“-”作为
输出文件名将完成同样的事情。
使用 onworks.net 服务在线使用 bp_seqretp