这是命令 cassiopee,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
cassiopee - Cassiopee 1.0 版的手册页
概要
仙后座 [菜单]
商品描述
用法:
-l:最大索引深度/最大图案尺寸
-u: 保存索引以备后用
-s: 索引序列
-p: 搜索模式
-f: 包含要搜索的模式的文件
-o: 输出文件
-r:应用树木减少
-m: 搜索模式: 0=DNA, 1=RNA, 2=Protein
-a: 允许字母歧义搜索
-n: 搜索中允许的最大连续 N 个匹配项
-e: 搜索中允许的最大替换匹配
-i: 搜索中允许的最大 indel 匹配
-g: 生成图形的点文件
-d: 图形的最大深度
-t: 输出格式: 0:tsv (默认), 1:json
-x: 顺序最小位置
-y: 顺序最大位置
-v: 显示版本
-h: 显示此消息
使用 onworks.net 服务在线使用 cassiopee