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reformatx - 卷重新格式化

概要

reformatx [选项] --floating floatingImg 目标 x0 [x1 ...]
或 reformatx [选项] 目标 [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
OR WHERE x0 ... xN 和 xx0 ... xxN 是 [{-i,--inverse}] 变换##。 （如果第一个
序列中的变换被反转，那么'--inverse'前面必须有'--'，
即，使用'---inverse xform.path'）。

商品描述

扩展的体积重新格式化工具，用于计算重新格式化的图像和雅可比映射
任意串联变换序列

配置

全球 工具包 附加选项 （这些 ，那恭喜你， 共用的， by 所有 CMTK 工具）
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。

--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。

--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。

- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。

- 版
将工具包版本写入标准输出。

- 回声
将当前命令行写入标准输出。

--详细级别
设置详细级别。

--详细, -v
将详细级别增加 1（已弃用；支持向后兼容）。

--线程
设置最大并行线程数（对于 POSIX 线程和 OpenMP）。

--输出类型
输出图像的标量数据类型。 支持的值：“char”、“byte”、“short”、
“ushort”、“int”、“uint”、“float”、“double”，或使用以下选项之一：

--字符
8 位，有符号

- 字节
8 位，无符号

- 短的
16 位，有符号

--ushort
16 位，无符号

--int
32 位有符号

--uint
32 位无符号

- 漂浮
32 位浮点数

- 双倍的
64 位浮点数

--填充输出 , -P
输出图像的填充值 [默认： 0]

附加选项 朴素 重新格式化
--插值
图像插值方法。 支持的值：“linear”、“nn”、“cubic”、“pv”、“sinc-
cosine”、“sinc-hamming”，其中默认值为“linear”，或使用以下选项之一：

--线性
三线性插值 [这个 is 此 默认]

--nn 最近邻插值

- 立方体
三三次插值

--光伏发电 部分体积插值

--正余弦
带余弦窗口的 Sinc 插值

--sinc汉明
带汉明窗的 Sinc 插值

--sinc-窗口半径
Sinc 插值的窗口半径 [默认： 3]

--保留质量
保留质量的重新格式化：将每个重新格式化的值与雅可比行列式相乘
应用转换的决定因素。

附加选项 雅可比式 地图位置 重新格式化
--jacobian-正确-全局
更正全球比例的雅可比映射。

--没有雅可比正确的全局
不要更正全球比例的雅可比映射。 [这个 is 此 默认]

输入 附加选项
--目标网格
将目标网格定义为 Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
（变暗：像素：偏移）

- 面具, -m
使用目标像素数据作为二进制掩码。

- 庄稼
裁剪目标图像：x0,y0,z0,x1,y1,z2

--目标偏移量 , -O
覆盖目标图像偏移并设置为 x,y,z mm

--目标偏移像素
覆盖目标图像偏移并设置为 dx,dy,dz 像素

- 漂浮的 , -F
浮动图像的格式和路径。 [默认： 没有任何]

--pad-浮动
浮动图像的填充值 [默认： 已禁用]

输出 附加选项
--输出文件 , -o
输出图像的格式和路径。 [默认： 重新格式化.nii ]

图像/转换 数据库
- D b
应使用新创建的图像/转换数据库更新的路径
图片。 [默认： 没有任何]

作者

Torsten Rohlfing，Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko

使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-reformatx