这是命令 cmtk-unwarp_image_phantom 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
unwarp_image_phantom - 创建变换以根据幻影解开图像
描述
概要
反扭曲图像幻影 输入幻影 输入图像 输出Xform
商品描述
该工具计算多项式变换或 B 样条自由形式变形
解开图像。 转换基于预期和检测到的地标
在同一台扫描仪上获得的结构体模图像。 使用“detect_adni_phantom”
检测图像中 ADNI Phantom 地标并生成幻影的工具
适合与此工具一起使用的描述文件。
配置
全球 工具包 附加选项 (这些 ,那恭喜你, 共用的, by 所有 CMTK 工具)
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。
--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。
--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。
- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。
- 版
将工具包版本写入标准输出。
- 回声
将当前命令行写入标准输出。
--详细级别
设置详细级别。
--详细, -v
将详细级别增加 1(已弃用;支持向后兼容)。
--线程
设置最大并行线程数(对于 POSIX 线程和 OpenMP)。
配件 附加选项
--拟合逆
拟合逆变换(将实际映射到预期的地标位置)。 这是
用于计算 Jacobian 体积校正图(使用 'reformatx')而无需
必须在数值上反转拟合的展开变换。
--适应前进
拟合前向变换(映射到实际地标位置)。 这是
用于通过重新切片(使用“reformatx”)来校正图像。 [这个 is 此
默认]
转型 型号
--样条
拟合 B 样条自由形式变形。
--聚
拟合多项式变换。 [这个 is 此 默认]
多项式 配件 附加选项 (与 --聚)
- 程度
拟合多项式变换的次数。 [默认: 4]
B样条 配件 附加选项 (与 --样条)
--final-cp-间距
输出 B 样条变换的最终控制点网格间距。 [默认: 0]
--最终 cp-dims
输出B-的最终控制点网格尺寸(即控制点数)
样条变换。 以“dimX,dimY,dimZ”的形式提供。 [默认: 没有任何]
--级别
多级 B 样条近似程序中的级数。 [默认: 1]
--每级迭代次数
多级中每级最大样条系数更新迭代次数
B 样条近似程序。 [默认: 100]
--rms-阈值
RMS 拟合残差相对改善的阈值。 拟合迭代
如果 (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < 阈值,则终止。
[默认: 0]
--不适合仿射
禁用仿射变换拟合以初始化样条。 相反,拟合样条
直接地。 这通常会产生更糟糕的结果,因此不鼓励这样做。
作者
Torsten Rohlfing,Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko
使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-unwarp_image_phantom