这是 delta2blocks 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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delta2blocks - 一个额外的工具,用于从 mugsy 补丁到排序对齐的 mummer
delta2maf - 用于从 mugsy 补丁到排序对齐的 mummer 的额外工具
概要
delta2块 [选项]<参考身份证><qry身份证>
德尔塔2maf [选项]<参考身份证><qry身份证>
商品描述
-h 显示帮助信息
-q 按查询起始坐标对路线进行排序
-r 按参考起始坐标对路线进行排序
-w int 设置屏幕宽度 - 默认为 60
-x int 设置矩阵类型 - 默认为 2 (BLOSUM 62),其他选项包括 1 (BLOSUM 45)
和 3 (BLOSUM 80)
注意:只对氨基酸比对有影响
输入是传递给“nucmer”或“promer”程序的 .delta 输出
命令行。
输出到标准输出,并包含查询和参考之间的所有对齐
在命令行上识别的序列。
注意:默认情况下不进行排序,因此对齐方式将按照在
这输入。
使用 onworks.net 服务在线使用 delta2blocks