这是 EDTSurf 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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EDTSurf - 快速准确地构建大分子表面
概要
EDTS冲浪 -i 数据库名...
商品描述
EDTSurf 是一个开源程序,用于构建大分子的三角曲面。 它
产生三个主要的大分子表面:范德华表面,溶剂可及
表面和分子表面(不包括溶剂的表面)。 EDTsurf 还可以识别蛀牙
它们在大分子内部。
配置
-o 外号
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-纯2-原子3-链
-p 探针半径 [0,2.0]
-f 比例因子 (0,20.0]
-h 1进出2出3进
输出1:outname.ply
输出2:outname.asa
输出3:outname-cav.pdb
使用 onworks.net 服务在线使用 EDTSurf